У нас есть многомерный массив, где есть дубли:Весь наш массив в переменной $input. Теперь выполним разборку массива, удаление дубликатов и сборку. Получим правильный массив
У нас есть многомерный массив, где есть дубли:

$input = Array(
   [0]=>Array(
        [0]=>pen,
        [1]=>ten
    ),
    [1]=>Array(
        [0]=>ren,
        [1]=>ten
    ),
    [2]=>Array(
        [0]=>pen,
        [1]=>to
    )
);

Весь наш массив в переменной $input;

Теперь выполним разборку массива, удаление дубликатов и сборку:

array_map("unserialize",array_unique(array_map("serialize",$input)));